Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc180J3QNE4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc180J3QNE4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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