Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Top6blJ3QMY9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Top6blJ3QMY9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Top6blJ3QMY9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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