Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3415J3QMS8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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