Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm20825J3QM67 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20825J3QM67 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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