Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20830J3KML6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm20830J3KML6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20830J3KML6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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