Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcf11G3X9Z4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms