Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-M1F7CXU4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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