Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm28048F7BCN0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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