Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Gm20538F6Z9R1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms