Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Crocc2F6XLV1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crocc2F6XLV1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms