Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm8247F6VRJ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm8247F6VRJ8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm8247F6VRJ8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm8247F6VRJ8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm8247F6VRJ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Gm8247F6VRJ8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm8247F6VRJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm8247F6VRJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8247F6VRJ8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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