Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sptbn5F6UCX4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sptbn5F6UCX4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms