Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syngap1F6SEU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms