Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm340F6RGI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms