Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rdh16f1E9Q9P8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh16f1E9Q9P8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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