Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6P5

Ttc7b, Tetratricopeptide repeat protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc7bE9Q6P5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc7bE9Q6P5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc7bE9Q6P5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms