Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc85cE9Q6B2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms