Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pate1E9Q658 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pate1E9Q658 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pate1E9Q658 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pate1E9Q658 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pate1E9Q658 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pate1E9Q658 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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