Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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NbasE9Q411 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NbasE9Q411 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms