Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms