Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms