Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5415E9PXF3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms