Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc8E9PWG2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms