Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms