Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms