Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3543D3Z235 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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