Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d4D3YUH6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms