Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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