Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prrt4B2RU40 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Prrt4B2RU40 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prrt4B2RU40 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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