Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Uhrf1bp1B2KF50 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms