Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a6B1AVK5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a6B1AVK5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a6B1AVK5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a6B1AVK5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a6B1AVK5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a6B1AVK5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Col4a6B1AVK5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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