Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik3B1AS29 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms