Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef20B1ARV6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pramef20B1ARV6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pramef20B1ARV6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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