Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Prr29B1ARI9 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prr29B1ARI9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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