Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms