Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp2c2A7L9Z8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp2c2A7L9Z8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms