Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms