Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms