Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CtcflA2APF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms