Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Lcn6A2AJB9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lcn6A2AJB9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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