Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms