Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb4A2A863 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms