Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PdfS4R2K0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PdfS4R2K0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms