Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdac5Q9Z2V6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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