Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp5Q9Z2P8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms