Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Crlf3Q9Z2L7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crlf3Q9Z2L7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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