Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn8Q9Z260 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms