Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek4Q9Z1J2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms