Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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