Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn2Q9Z0I6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms